La colaboración de SGI con desarrolladores de software estratégicos optimiza los resultados de las investigaciones

Las soluciones de flujo de trabajo científico de SGI® proporcionan un nuevo enfoque que permite a las organizaciones científicas desplegar la mejor plataforma de computación para cada aplicación permitiendo agilizar los descubrimientos en áreas de investigación como genómica, proteómica, bioinformática, secuencia genómica y nuevos fármacos.

"El típico entorno de computación científica de hoy en día debe soportar una jerarquía de aplicaciones diferentes y de trabajos de investigación que juntos se suman al trabajo empresarial de la organización", ha declarado Deepak Thakkar, Director del Sector de Biociencia de SGI. "Antes que forzar a todas las aplicaciones y trabajos dentro de una única arquitectura, se puede desarrollar una solución integrada de computación de alto rendimiento que proporcione una experiencia uniforme al usuario final pero que esté personalizada hacia las necesidades de cada cliente y aplicación en particular. Para que una solución que ha de atender los trabajos en un entorno científico tenga éxito debe soportar de manera óptima cada aplicación o trabajo específico, a la vez que proporciona a los usuarios la sensación de utilizar un único sistema. Asimismo, ha de adaptarse rápidamente a la naturaleza impredecible de la investigación científica. Las soluciones para trabajos científicos de SGI, que pueden consistir en clusters, almacenamiento y servidores, así como en sus programas RASC, son todas altamente configurables, ofrecen la sensación de utilizar un único sistema y están altamente optimizadas para investigación biológica".

Las soluciones de trabajos científicos de SGI operan en entorno Linux® y están dirigidas a empresas farmacéuticas y biotecnológicas, así como a investigadores. Estas soluciones se pueden configurar de manera optimizada específicamente para satisfacer las necesidades del cliente y, sobre la base de la arquitectura SGI® NUMAflex™, permiten escalar fácilmente para satisfacer las necesidades futuras.

Los sistemas de SGI que específicamente se pueden emplear en este tipo de soluciones de investigación son: los servidores de altas prestaciones SGI® Altix® con procesadores Intel® Itanium® 2 Dual Core, clusters de alto rendimiento SGI Altix XE basados en procesadores Intel® Xeon® Quad-Core, y blades de computación SGI RASC RC100 (FPGAs optimizados para aplicaciones estratégicas que ofrecen unas capacidades especializadas), así como los sistemas SGI® InfiniteStorage altamente escalables. Las configuraciones pueden estar compuestas por cualquier hardware de SGI, junto con la elección del usuario de productos ISV altamente optimizados para la arquitectura de sistema de SGI. Entre las compañías con las que SGI colabora para proporcionar las mejores soluciones en investigación científica, destacan:

BioTeam
BioTeam (http://web.bioteam.net) es un colectivo de consultores dedicado a ofrecer soluciones informáticas a la industria biológica. BioTeam ha estado ofreciendo sus servicios a la comunidad farmacéutica y biotecnológica durante varios años. Sus directores poseen una gran experiencia en distintas áreas, desde el análisis científico hasta infraestructuras de computación técnica de alto rendimiento. BioTeam ha cubierto con éxito la distancia entre ciencia y tecnología.

"La oferta tecnológica de SGI incluye un conjunto muy completo de soluciones", ha declarado Stan Gloss, Director General de The BioTeam, Inc. "Su catálogo incluye todas las piezas necesarias para cubrir las numerosas necesidades de la investigación biológica. Desde servidores únicos con procesadores estándar, hasta hardware reconfigurable, e incluso una gran variedad de socios tecnológicos. SGI verdaderamente cumple todos nuestros requisitos."

eXludus Technologies
eXludus Technologies (www.exludus.com) dispone del paquete de software GridOptimizer, diseñado para escalar el rendimiento computacional de clusters y Grids. La capacidad de programar gracias a la precisión del componente Schedule Optimizer (SchedOpt) es aplicable a una amplia gama de cargas de trabajo, tanto sobre clusters pequeños como grandes. Esta tecnología incrementa el rendimiento de cualquier infraestructura informática, de servidor de fichero y de conectividad, permitiendo que grandes cantidades de procesamiento y de datos fluyan sin retrasos, e interactúen directamente con los sistemas de gestión de trabajo con un mínimo esfuerzo de integración.

"Estamos muy satisfechos de contribuir a las soluciones de trabajos científicos de SGI que han incorporado nuestra tecnología para mejorar drásticamente las prestaciones en el procesamiento de análisis proteómico y genómico sobre clusters y Grids", ha declarado Stephen Perrenod, Vicepresidente de Ventas y Marketing de eXludus Technologies. "Nuestro conjunto de herramientas Grid Optimizer proporciona el dinamismo y la rapidez necesarios en los tiempos de reacción para acelerar las prestaciones de grandes trabajos sobre clusters multi-core."

eXludus ha anunciado recientemente que SchedOpt incrementa las prestaciones del procesamiento sobre clusters hasta 8 veces. En un test comparativo, se activó SchedOpt sobre un cluster SGI® Altix® XE de 24 cores que estaba ejecutando NCBI-BLAST, la principal herramienta para comparación de secuencias en Bioinformática. SchedOpt mejoró el rendimiento (eficiencia de CPU) en 8,76 veces.

Mitrionics
Mitrionics, Inc. (www.mitrionics.com) es la tecnología líder en el novísimo campo de Supercomputación FPGA, que proporciona una potencia de procesamiento mayor para ejecutar aplicaciones de supercomputación a la vez que consume menos energía que los clusters clásicos. La aplicación Mitrion-accelerated BLAST consigue unos incrementos en prestaciones hasta 19 veces superiores a los procesadores tradicionales y es la primera aplicación acelerada en el proyecto Mitrion-C Open Bio. Este proyecto es un programa en marcha en el que Mitrionics está desarrollando aplicaciones clave para la industria bioinformática, poniendo estas aplicaciones a disposición de la comunidad open source a través de www.sourceforge.net. La próxima aplicación disponible será BLASTp, de la que está prevista una versión beta en Septiembre 2007.

Soluciones RCH
Especializada en institutos de investigación, de biotecnología y farmacéuticos, así como en la industria sanitaria, RCH (www.rchsolutions.com) ha estado diseñando y desarrollando durante más de 15 años soluciones para empresas de cualquier tamaño, desde las incluidas en Fortune 500 hasta pequeñas y medianas empresas. Como socio estratégico de canal de SGI, RCH ofrece una exhaustiva línea de servidores blade, clusters, almacenamiento, redes SAN y NAS, computación grid, virtualización, mantenimiento de sistemas y soluciones de gestión de contenido. RCH cubre áreas como Biología Computacional, Química Computacional, Informática aplicada a la Química, Bioinformática y Análisis Clínicos y ofrece un amplio conjunto de soluciones TI y consultoría, proporcionando a los investigadores la flexibilidad de implementar la tecnología apropiada para su entorno.

"RCH está muy satisfecha con las nuevas prioridades de SGI por ofrecer soluciones de computación de alto rendimiento verdaderamente escalables a la comunidad científica", ha declarado Michael Riener, Vicepresidente de Desarrollo de Negocio de RCH Solutions. "Nuestros clientes continúan requiriendo sistemas con mejores prestaciones para satisfacer las exigencias únicas de sus distintas aplicaciones de investigación. Estamos convencidos de que SGI destaca en esta área".

Teranode Corporation
Teranode Corporation (www.teranode.com) es el innovador líder de software informático que permite a los científicos automatizar, gestionar y unificar datos experimentales y trabajos en un entorno I+D de cambios constantes. Los prestigiosos productos de Teranode ofrecen formas innovadoras para simplificar el ciclo de vida de I+D, proporcionando las herramientas que permiten a los científicos definir su propia manera de trabajar y su modelo de captura de datos, satisfaciendo su necesidad de flexibilidad. El software de la compañía ayuda a los científicos a crear una manera de integrar los formatos fragmentados, así como los grandes volúmenes de datos de experimentos e información "in-silico", eliminando las barreras existentes y ofreciendo business intelligence en tiempo real, así como mejorando la calidad de los datos y el proceso de toma de decisiones.

"La flexibilidad de nuestra plataforma de automatización de diseño experimental nos ha permitido convertirnos en una plataforma de I+D virtual para varios de nuestros clientes estratégicos", ha declarado Joseph Duncan, CEO de Teranode Corporation. "La plataforma de hardware y el software de alto rendimiento de SGI añaden escalabilidad empresarial a nuestra flexibilidad."

Silicon Graphics, también conocida como SGI, dispone de una completa gama de soluciones de almacenamiento y de servidores de altas prestaciones, así como de unos servicios profesionales y de soporte líderes en la industria, que permiten a sus clientes superar complejos retos de flujos de trabajo y colaborar en los avances científicos, la innovación y la transformación de la información. El objetivo de SGI es ayudar a sus clientes a superar sus retos informáticos, tanto compartiendo imágenes para colaborar en avanzadas operaciones médicas en el cerebro, como diseñando y fabricando vehículos y aviones más seguros y eficientes, estudiando la climatología mundial, proporcionando tecnología para seguridad nacional y defensa, permitiendo la transición de las transmisiones analógicas a digitales, o ayudando a las empresas a gestionar grandes volúmenes de datos. Con oficinas en todo el mundo, la sede de la compañía está en Mountain View, California, y su página web es www.sgi.com.

Silicon Graphics, SGI, el cubo SGI y el logo SGI son marcas registradas. The Source of Innovation and Discovery es marca registrada de Silicon Graphics, Inc., en los Estados Unidos y/u otros países en todo el mundo. Todas las demás marcas registradas mencionadas son propiedad de sus respectivos dueños.

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